Такое деление имеет существенное эпидемиологическое значение, поскольку преимущественная принадлежность основных хозяев возбудителей инфекций к той или иной среде обитания в значительной степени определяет степень и форму общения с ними человека и, следовательно, интенсивность их распространения в человеческом обществе. Вполне очевидно, что инфекции, получаемые человеком от домашних и постоянной близости с ними человека имеют гораздо большую эпидемиологическую опасность по сравнению с болезнями, с основными хозяевами возбудителей которых человек может встретиться лишь в условиях относительно девственной природы.
По этиологии зоонозы разделяют на бактериальные (бруцеллез, чума, туляремия, кампилобактериоз, лептоспироз, сальмонеллез, сибирская язва, риккетсиозы, хламидиозы, боррелиозы), вирусные (геморрагические лихорадки, бешенство) и прионные (скрепи губчатая энцефалопатия) инфекции.